高山族還保留有原始宗教的信仰和儀式。他們崇拜精靈，各地信仰的神不一，有天神、創(chuàng)造宇宙之神、自然神、司理神和其他精靈妖怪。祭儀有農事祭(包括開墾祭、播種祭、除草祭、收刈祭、新谷入倉祭等，主要的是粟祭)、狩獵祭、漁祭、祖靈祭等。盛行巫術，其中卜占方法有鳥卜、夢卜、水占、竹占、瓢占、飯占等，并有多種形式的巫書。由于漢族移民和荷蘭、西班牙殖民者的影響，高山族宗教信仰復雜。漢族帶去了佛教、西方傳教士帶去了基督教、天主教等。這幾種宗教都在高山族群眾中生根，高山族宗教生活中形成原始宗教信仰、佛教和西方宗教等交錯并立的局面。